OUAFIK L’Houcine

OncoBiologie

Tél. secrétariat : 04 91 69 88 82/83
Fax : 04 91 69 88 82
Faculté de Médecine Nord, Bâtiment A, 2ème étage

Chefs de service

Equipe
medecins: 

Chefs de Service
 

  • Pr L’Houcine OUAFIK (PU-PH)
  • Pr Jean GABERT (PU-PH)


Biologistes Médicaux

  • Dr Isabelle NANNI-METELLUS (PH)
  • Dr Christel PISSIER (PA)


Cadre médico-technique

  • Stéphane LEGRAND


Secrétariat

  • Angélique FEDELE
  • Agnès-Marie ELHADOUCHI


Services communs

  • Hervé CHENOLL
  • Colette LLOVET


Techniciens

  • Odile BARNEOUD
  • Véronique BRICE
  • Marie-Christine COURTIER
  • Annick DURAND
  • Cindy FERNANDEZ-MUNIZ
  • Fréderic FRASSINETI
  • Christine GIUSTI
  • Christine SCHIANO
  • Mireille SOULA
  • Christelle TAILLANDIER
  • Corinne TERLIER
  • Emmanuelle TOUSSSAINT


Ingénieurs

  • Dr Sylvie DESRUISSEAU
  • Dr Antoine CARLIOZ
  • Nathalie BEAUFILS
  • Eric PELLEGRINO
Chefs de services: 
Pathologies
Pathologies: 
  • Cancer bronchopulmonaires et pleuraux
  • Cancers digestifs
  • Cancers uronéphrologiques
  • Cancers du sein
  • Cancer gynécologiques
  • Cancers de la peau
  • Cancers de la tête et du cou
  • Cancers du système nerveux central
  • Lymphomes, leucémies aigues, syndromes myéloprolifératifs
  • Lésions précancéreuses et cancer du col de l’utérus

Techniques et traitements
Techniques et traitements: 

Catalogue des analyses (document Excel, extension XLS)

 

Secteur de biologie moléculaire :

 

  • Techniques de génétique moléculaire
  • Techniques de biologie moléculaire
  • Extraction, dosage et qualification d’acides nucléiques
  • Conversion d’ARN par reverse-transcriptase
  • PCR quantitative, Droplet Digital PCR
  • Analyse par fusion d’amplicons (High Resolution Melting)
  • Séquençage Sanger
  • Séquençage Ion Proton (NGS) : panels Oncomine Solid Tumor (KRAS, EGFR, BRAF, PIK3CA, AKT1, PTEN, NRAS, HRAS, STK11, MAP2K1, ALK, DDR2, CTNNB1, MET, TP53, SMAD4, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, NOTCH1, ERBB4, KIT, PDGFRa, POLE, RET, ROS.), panel Oncomine BRCA1, BRCA2, gènes impliqués dans la recombinaison homologue, panel gliomes : (AKT1, ATRX, BRAF, CDKN2A, CIC, EGFR, FGFR1, H3F3A, HIST3B, IDH1, IDH2, NOTCH1, PIK3CA, PIK3R1, PTEN, PTPN11, TERT, TP53)  et recherche de transcrits de fusion pour les gènes ALK, ROS, RET, NTRK1, NTRK2, et NTRK3.
  • Détection par sonde d’hydrolyse (Taqman, Cobas)

 

Secteur de biochimie :

 

  • Dosage des marqueurs tumoraux par immunoanalyse
  • Dosage et chromatographie de la prolactine
  • Phénotypage de la CDA par technique ELISA

 

Secteur d’onco-hématologie :

 

  • PCR en temps réel et PCR multiplex (bcr-abl, BCR-ABL et FIP1L1-PDGRFRa, Jak2 V617F)
  • Recherche de mutations (calréticuline, Jak2 exon 12, MPL) par technique HRM et par séquençage
  • Séquençage Ion Proton (NGS) : panel myéloïde développé en interne (ASXL1, CALR, CBL, CEBPA, CXCR4, DNMT3A, EZH2, FLT3, GATA2, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, PTEN, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, WT1.)
Publications
Publications: 

Tomasini P, Barlesi F, Gilles S, Nanni-Metellus I, Soffietti R, Denicolai E, Pellegrino E, Bialecki E, Ouafik L, Metellus P. Comparative genomic analysis of primary tumors and paired brain metastases in lung cancer patients by whole exome sequencing: a pilot study. Oncotarget. 2020 Dec 15;11(50):4648-4654. doi:10.18632/oncotarget.27837. PMID: 33400739.
 
Beau-Faller M, Pencreach E, Leduc C, Blons H, Merlio JP, Bringuier PP, de Fraipont F, Escande F, Lemoine A, Ouafik L, Denis M, Hofman P, Lacave R, Melaabi S, Langlais A, Missy P, Morin F, Moro-Sibilot D, Barlesi F, Cadranel J; French Cooperative Thoracic Intergroup (IFCT). Independent prognostic value of ultra-sensitive quantification of tumor pre-treatment T790M subclones in EGFR mutated non-small cell lung cancer (NSCLC) treated by first/second generation TKI, depends on variant allele frequency (VAF): Results of the French cooperative thoracic intergroup (IFCT) biomarkers France project. Lung Cancer. 2020 Feb;140:19-26. doi: 10.1016/j.lungcan.2019.10.013.  Epub 2019 Nov 15. PMID:31841714.

Kembou Nzale S, Weeks WB, Ouafik L, Rouquette I, Beau-Faller M, Lemoine A, Bringuier PP, Le Coroller Soriano AG, Barlesi F, Ventelou B. Inequity in access to personalized medicine in France: Evidences from analysis of geo variations in the access to molecular profiling among advanced non-small-cell lung cancer patients: Results from the IFCT Biomarkers France Study. PLoS One. 2020 Jul 1;15(7):e0234387. doi: 10.1371/journal.pone.0234387. PMID: 32609781; PMCID:PMC7329126.
 
Jeanson A, Tomasini P, Souquet-Bressand M, Brandone N, Boucekine M, Grangeon M, Chaleat S, Khobta N, Milia J, Mhanna L, Greillier L, Biemar J, Nanni I, Ouafik L, Garcia S, Mazières J, Barlesi F, Mascaux C. Brief report: efficacy of immune checkpoint inhibitors in KRAS-mutant Non-small cell lung cancer (NSCLC). J Thorac Oncol. 2019 Jun;14(6):1095-1101. PMID: 30738221.
 
Frankel D, Nanni-Metellus I, Robaglia-Schlupp A, Tomasini P, Guinde J, Barlesi F, Astoul P, Ouafik L, Amatore F, Secq V, Kaspi E, Roll P. Detection of EGFR, KRAS and BRAF mutations in metastatic cells from cerebrospinal fluid. Clin Chem Lab Med. 2018; 56(5):748-753. PMID: 29306909.
 
Guibert N, Barlesi F, Descourt R, Léna H, Besse B, Beau-Faller M, Mosser J, Pichon E, Merlio JP, Ouafik L, Guichard F, Mastroianni B, Moreau L, Wdowik A, Sabourin JC, Lemoine A, Missy P, Langlais A, Moro-Sibilot D, Mazières J. Characteristics and Outcomes of Patients with Lung Cancer Harboring Multiple Molecular Alterations: Results from the IFCT Study Biomarkers France. J Thorac Oncol. 2017; 12:963-973. PMID: 28189832.
 
Barlesi F, Mazieres J, Merlio JP, Debieuvre D, Mosser J, Lena H, Ouafik L, Besse B, Rouquette I, Westeel V, Escande F, Monnet I, Lemoine A, Veillon R, Blons H, Audigier-Valette C, Bringuier PP, Lamy R, Beau-Faller M, Pujol JL, Sabourin JC, Penault-Llorca F, Denis MG, Lantuejoul S, Morin F, Tran Q, Missy P, Langlais A, Milleron B, Cadranel J, Soria JC, Zalcman G; Biomarkers France contributors. Routine molecular profiling of patients with advanced non-small-cell lung cancer: results of a 1-year nationwide programme of the French Cooperative Thoracic Intergroup (IFCT). Lancet. 2016. 387(10026):1415-26. PMID: 26777916.
 
Berenguer-Daizé C, Astorgues-Xerri L, Odore E, M Cayol M, Cvitkovic E, Noel K, Bekradda M, MacKenzie S, Keyvan Rezai K, Lokiec F, Riveiro M.E, Ouafik L. OTX015 (MK-8628), a novel BET inhibitor, displays in vitro and in vivo antitumor effects alone and in combination with conventional therapies in glioblastoma. Int. Journal of Cancer. 2016; 139(9):2047-55. PMID: 27388964.
 
White HE, Matejtschuk P, Rigsby P, Gabert J, Lin F, Lynn Wang Y, Branford S, Müller MC, Beaufils N, Beillard E, Colomer D, Dvorakova D, Ehrencrona H, Goh HG, El Housni H, Jones D, Kairisto V, Kamel-Reid S, Kim DW, Langabeer S, Ma ES, Press RD, Romeo G, Wang L, Zoi K, Hughes T, Saglio G, Hochhaus A, Goldman JM, Metcalfe P, Cross NC. Establishment of the first World Health Organization International Genetic Reference Panel for quantitation of BCR-ABL mRNA. Blood. 2010 Nov 25;116(22):e111-7. PMID: 20720184.
 
Bennour A, Beaufils N, Sennana H, Meddeb B, Saad A, Gabert J. E355G mutation appearing in a patient with e19a2 chronic myeloid leukaemia resistant to imatinib. J Clin Pathol. 2010 Aug;63(8):737-40. PMID: 20702476.
 
Dales JP, Beaufils N, Silvy M, Picard C, Pauly V, Pradel V, Formisano-Tréziny C, Bonnier P, Giusiano S, Charpin C, Gabert J. Hypoxia inducible factor 1alpha gene (HIF-1alpha) splice variants: potential prognostic biomarkers in breast cancer. BMC Med. 2010 Jul 12;8:44. PMID: 20624301.
 
Thuny C, Gaudy-Marqueste C, Nicol I, Gabert J, Costello R, Grob JJ, Richard MA. Chronic eosinophilic leukaemia revealed by lymphomatoid papulosis: the role of the FIP1-like 1-platelet-derived growth factor receptor alpha fusion gene. J Eur Acad Dermatol Venereol. 2010 Feb;24(2):234-5. PMID: 19686260.

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